花海镇现辖5个行政村，34个村民小组，总人口11803人，3240户，总面积4011平方公里，约占玉门市总面积的三分之一。耕地面积4.2万亩，有可开垦荒滩、荒地20多万亩。区域内有五个农场、一个民族乡、一个移民基地。包括周边团场、乡镇，区域内总人口达3.6万人，耕地15万亩。2002年七月撤乡建镇，2003年1月被批准为全省小城镇综合改革试点镇，同年被省建设厅授予“全省村镇建设先进乡镇”称号，2004年被酒泉市委授于“十强”乡镇，2004年2月批准成立了省级乡镇企业项目示范区。

近年，花海镇按照建设区域中心的发展思路，大力调整产业结构，不断加大城镇、项目建设力度，目前已形成棉花、“花海蜜”食用瓜、草畜三大产业，农民人均纯收入2005年接近5000元。在城镇建设上，把城镇基础设施、乡镇企业示范区、小康住宅建设有机结合起来，先后在镇区建成了中小学、幼儿园教学楼、学生宿舍实验楼、中心卫生院、水管处、邻镇村委会等办公楼14栋、14200多平方米；围绕主导产业建成加工企业8个、占地面积10万平方米；建成商贸、流通等服务工程4项、12000多平方米；建成商业网点340个，10000多平方米。建成区面积由2002年以前的不足30公顷拓展到目前的68公顷，街道由原来的一条，发展到目前的三横三纵6条，行政区、商贸区、住宅区、工业区等功能区初步区划。同时，先后投资1500多万元，完成了5.8公里道路拓宽、3公里供暖线路、11公里供水线路、2.9公里供电线路、3.8公里通讯光缆改造工程和5公里排污工程等建设，镇区的供电、供热、给排水、通讯、邮电、金融、有线电视网络等基础设施基本配套，教育、医疗、文化、卫生等功能齐全，商贸、流通、服务等网点快速建设，基本满足了本地居民的生产生活需求。城镇带动效应日趋显著。2003年以来，共引进资金1.5亿元，建成了加工、建筑、建材、商贸流通项目24个；新增个体工商户300户，零售业、餐饮业、娱乐业、信息产业、流通业都有了长足的发展；城镇集中了区域内80%以上的流通和交易活动，转移农村剩余劳动力的作用得到充分发挥，近三年，共有1500余名农民脱离了土地，在城镇居住。2005年，据初步统计，来我镇从事商贸经营活动的外来人员达到3万多人次，市场各类交易额8000余万元，城镇自身吸引资金、人口、信息和各种经营活动的功能不断增强，农民来自二三产业的收入占到了总收入的三分之一以上。

2014年7月，花海镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。